Попытка перейти к практике объединенного правительства и так решить проблему единства государственного управления завершилась конституированием Совета министров. Отвергая с порога попытки усиления значения «правительства», император вместе с тем осознавал справедливость разговоров об опасности разобщенности государственного управления и о необходимости единства в руководстве правительственной политикой, а потому попытался решить проблему на свой лад, не выпуская из рук ни крупицы власти. Для этого существовавший негласно Совет министров был реорганизован и получил юридический статус. Император сохранил председательство в Совете, а значит – полный контроль над деятельностью этого учреждения.
Столь же своеобразно как проблемы объединенного правительства и премьера была решена Александром II проблема однородности правительства, т. е. состава правительственных деятелей. Отвергая идею создания общероссийского представительного учреждения, а тем самым и путь к созданию однородного правительства на основе программы парламентского большинства, но образцу западноевропейских государств, он все же попытался решить эту задачу, отстранив «николаевских» деятелей и назначив министрами людей, более готовых к решению новых задач. Именно на конец 1861 г. – начало 1862 г. приходится ряд перемен в правительственном составе: в Министерство финансов вместо А. М. Княжевича приходит М. X. Рейтерн, в Министерство народного просвещения вместо Е. В. Путятина – Л. В. Головнин, в Министерство государственных имуществ вместо М. II. Муравьева – А. Зеленый, в Министерство юстиции – Д. II. Замятин вместо И. Панина, во II отделение вместо Д. Н. Блудова назначается М. А. Корф.